灰绿藜和碱蒿 NHX 基因 3'-UTR 序列的差异性分析

李金耀 马纪 蔡伦 王艳 张富春*
新疆大学生命科学与技术学院分子生物学重点实验室,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830046

通信作者:张富春;E-mail: zfc@xju.edu.cn;Tel: 0991-8583517

摘 要:

采用 3'末端快速扩增技术,分别从新疆野生盐生植物灰绿藜和碱蒿中克隆 CgNHX 和AaNHX cDNA 3'末端。测序结 果表明克隆获得的片段为 CgNHX 和 AaNHX 基因 3'末端,并且 CgNHX 和 AaNHX 3'-UTR 的不同拷贝之间存在很大的差异 性。序列同源性分析结果显示,AaNHX 基因 3'-UTR 与 CgNHX 基因 3'-UTR 同源性高达 52%,两者与 SsNHX(碱蓬 NHX)同 源性分别达到 60% 和 54%,表明 NHX 基因的加工方式可能相同,同时说明该基因在野生盐生植物中的功能是很重要的。

关键词:灰绿藜; 碱蒿; NHX 基因; 3'-UTR; 植物耐盐

收稿:2004-04-14   修定:2004-10-28

资助:国家科技攻关西部科技行动项目(2001BA901A32)和国家“863”项目(2004AA227110-2)。

灰绿藜和碱蒿 NHX 基因 3'-UTR 序列的差异性分析

李金耀 马纪 蔡伦 王艳 张富春*
新疆大学生命科学与技术学院分子生物学重点实验室,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830046

Corresponding author: ; E-mail: zfc@xju.edu.cn; Tel: 0991-8583517

Abstract:

采用 3'末端快速扩增技术,分别从新疆野生盐生植物灰绿藜和碱蒿中克隆 CgNHX 和AaNHX cDNA 3'末端。测序结 果表明克隆获得的片段为 CgNHX 和 AaNHX 基因 3'末端,并且 CgNHX 和 AaNHX 3'-UTR 的不同拷贝之间存在很大的差异 性。序列同源性分析结果显示,AaNHX 基因 3'-UTR 与 CgNHX 基因 3'-UTR 同源性高达 52%,两者与 SsNHX(碱蓬 NHX)同 源性分别达到 60% 和 54%,表明 NHX 基因的加工方式可能相同,同时说明该基因在野生盐生植物中的功能是很重要的。

Key words: 灰绿藜; 碱蒿; NHX 基因; 3'-UTR; 植物耐盐

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